때는 2040년. 난치병에 걸린 청년 레이토는 소꿉친구 에리사와 재회를 맹세하고, 병을 치료하기 위해 콜드 슬립에 들어간다.
그리고 5년 후ㅡ 깨어난 레이토를 기다리고 있는 것은 99.9%의 남자들이 사멸하고 50억 명의 여성이 사는 세계였다…!